Les traces d’habitat hallstatien, les vestiges de civilisation romaine et des tombes mérovingiennes attestent l’occupation ancienne du site de Krautergersheim. Des actes écrits confirment entre autre les possessions de l’Abbaye de Murbach en 735, de l’Abbaye de Fulda en 778, du couvent du Hohenburg en 1050 et de l’Abbaye de Baumgarten en 1181.

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En 1587, lors des guerres de religion, le village est incendié par des mercenaires de passage. Durant la guerre de Trente ans, la cité est à nouveau mise à sac par les troupes de Manfeld, puis par les troupes suédoises.
A partir du XIVème siècle et jusqu’à la Révolution, plusieurs familles seigneuriales s’y succèdent. La famille Berckheim possède un château, dont Frédéric de Türckheim et son épouse Lili Schoenemann - l’amour de Goethe - se portent acquéreurs.
Au début du XVIème siècle, le préfixe kraut est ajouté au nom de la localité, pour la distinguer de son homonyme situé à proximité de Molsheim. Il témoigne de l’ancienneté de la culture intensive du chou et de la fabrication de la choucroute. Après la chute de l’Empire, des unités autrichiennes occupent Krautergersheim durant trois années.
Les activités se partagent entre la culture de la pomme de terre, la fabrication industrielle de choucroute, l’industrie du bâtiment et un fort secteur commercial.
